圓二色光譜法分析蛋白質二級結構
圓二色光譜（CD）是一種廣泛用於研究蛋白質二級結構和其變化的方法。透過分析蛋白質的CD光譜，可以得到其二級結構的大致組成和分佈。
一、蛋白質的二級結構主要包括：
圖1. 蛋白質結構鑑定
1、α螺旋 (Alpha Helices):
這是一種右手螺旋結構，通常在CD光譜的約222 nm和208 nm處顯示負峰。
2、β摺疊 (Beta Sheets):
β摺疊可以是平行或反平行的。它們在CD光譜的約218 nm處顯示正峰，而在約210-216 nm處顯示負峰。
3、β轉角 (Beta Turns):
這些結構在CD光譜中通常不產生很明顯的峰，但它們可以透過其在其他二級結構中的缺失來識別。
4、無規則捲曲 (Random Coils or Unstructured regions):
這些區域在CD光譜中在約195 nm處顯示負峰。
二、使用CD研究蛋白質二級結構的考慮因素：
1、CD光譜主要在紫外區域（UV，約190-250 nm）進行，因為蛋白質的二級結構在這個區域有特定的光譜特徵。
2、爲了獲得準確的二級結構資訊，需要確保樣品是純的，適當的溶劑和濃度也很重要。
3、透過比較不同條件下的CD光譜（如不同溫度、pH或配體存在），可以研究蛋白質的穩定性和構象變化。
4、有多種軟體和演算法可用於從CD光譜資料中計算蛋白質的二級結構成分，如CONTIN、SELCON和CDSSTR等。
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