hdx ms: 蛋白質結構動態的新視角
氫/氘交換質譜(HDX MS)是一種強大的技術,用於研究蛋白質的三維結構、摺疊、動態以及蛋白質之間或蛋白質與其他分子之間的相互作用。這種方法基於蛋白質氨基酸殘基側鏈中氫原子與氘(一種氫的同位素)的自然交換現象。
圖1
1.基本原理:
在含有氘的溶劑中,蛋白質的氨基酸殘基中的氫原子會被氘原子替換。這種氫/氘交換的速率可以透過質譜分析來測量,並且與蛋白質的結構和動態緊密相關。
2.動態資訊:
HDX MS可以提供有關蛋白質動態的資訊,包括哪些區域是相對固定的(較少的氫/氘交換)以及哪些區域是更加靈活的(較多的氫/氘交換)。這有助於瞭解蛋白質是如何工作的,以及它們的活動如何受到三維結構的影響。
3.蛋白質相互作用:
當蛋白質相互作用或與配體結合時,它們的氫/氘交換模式可能會改變。透過比較不同狀態下的交換模式,HDX MS可以幫助識別蛋白質相互作用介面或結合位點。
4.疾病研究和藥物開發:
HDX MS不僅可以幫助科學家理解疾病相關蛋白的結構和功能,還可以在藥物發現和開發過程中發揮作用,例如,透過識別潛在的藥物靶點或評估候選藥物與其靶點的結合特性。
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