賴氨酸在圓二色譜中的特徵峰分析
圓二色譜(Circular Dichroism, 簡稱CD)是一種研究蛋白質、核酸和其他生物大分子的二級結構和三級結構的技術。透過測量分子在特定波長下的旋光性,可以獲得有關其結構的資訊。
圖1
賴氨酸(Lys)本身的旋光性主要出現在遠紫外區的圓二色譜中。對於單一的賴氨酸或簡單的賴氨酸肽段,其特徵峰主要出現在遠紫外區(約190-240 nm)。賴氨酸在這一區域的主要CD訊號來源於其側鏈的ε-氨基團,而這些訊號往往與蛋白質的背骨結構產生的CD訊號混合在一起。因此,對於大的蛋白質結構,賴氨酸殘基的旋光性訊號可能會被背景的蛋白質結構訊號所掩蓋。
蛋白質的CD特徵峰主要是由其二級結構(如α-螺旋、β-摺疊、隨機捲曲等)決定的。對於蛋白質的二級結構,以下是一些常見的CD特徵峰:
1、α-螺旋:
有一個正的特徵峰在約190-195 nm和兩個負的特徵峰在208和222 nm。
2、β-摺疊:
有一個正的特徵峰在約195 nm和一個負的特徵峰在約215-218 nm。
3、隨機捲曲:
主要表現爲一個負的特徵峰在約200 nm附近。
需要注意的是,這些波長只是近似值,實際的特徵峰位置可能會因蛋白質的具體序列和條件而異。
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