組蛋白修飾用什麼檢測
組蛋白修飾檢測的核心原理是透過實驗手段來鑑定組蛋白上不同修飾位點的存在和位置。質譜是最常見鑒定翻譯後修飾的方法，尤其是LC-MS/MS，可以高通量地分析組蛋白樣品。
1.組蛋白提取：首先，需要從生物樣本中提取組蛋白。這可以透過細胞抽提或組織抽提等方法來實現。
2.化學標記或抗體富集：提取的組蛋白通常會經過化學標記（如TMT或iTRAQ標記）或抗體富集。這些標記或抗體可以選擇性地與特定修飾的組蛋白結合，以將它們從混合的組蛋白樣品中富集出來。
3.質譜分析：經過標記或富集的組蛋白樣品會透過質譜技術進行分析。常見的質譜技術包括液相色譜質譜聯用（LC-MS/MS）和飛行時間質譜（TOF-MS）等。
4.資料分析：質譜資料會經過生物資訊學分析，以確定組蛋白修飾位點的存在和位置。通常包括資料庫搜尋、定量分析和統計分析等步驟。
此外，以下幾種方法也可以用於分析組蛋白的翻譯後修飾情況：
1.免疫印跡（Western Blot）:
這種技術用於檢測特定的蛋白質，包括特定的組蛋白修飾。透過使用針對特定修飾（如乙醯化、甲基化）的抗體，可以檢測特定的組蛋白修飾。
2.免疫熒光（Immunofluorescence）:
在這種技術中，使用特異性抗體標記細胞中的組蛋白修飾，並透過熒光顯微鏡觀察。
3.染色質免疫沉澱（Chromatin Immunoprecipitation, ChIP）:
這種方法用於研究特定的DNA片段是否與特定的組蛋白修飾相關。透過使用針對特定修飾的抗體捕獲染色質片段，然後透過PCR、測序或其他方法進行分析。
4.酶聯免疫吸附測定（ELISA）:
類似於免疫印跡，這種技術使用抗體來檢測特定的蛋白質和修飾。ELISA適用於快速篩選和定量分析。
以上每種技術都有其優勢和侷限性，研究者通常會根據研究目的和樣本型別選擇適當的方法。例如，質譜提供最詳細的修飾資訊，但技術要求高且成本較高；而免疫印跡則相對簡單，但資訊量較少。
圖1.組蛋白翻譯後修飾鑑定研究路線
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