質譜圖怎麼看蛋白磷酸化位點
- 磷酸化肽段在質譜圖中有特定的訊號。磷酸基團的加入增加了肽段的質量（約79.966 Da）。因此，在質譜圖上，磷酸化肽段會在未修飾肽段的基礎上顯示一個相應的質量增加。
- 在MS/MS分析中，磷酸化肽段的斷裂往往導致磷酸基團的丟失（-98 Da），這可以在質譜圖中觀察到。
- 在串聯質譜（MS/MS）中，肽段的斷裂產生b系列和y系列離子。透過分析這些離子的序列，可以確定肽段的氨基酸序列。
- 磷酸化位點附近的離子峰會表現出質量的變化，透過比較修改前後的肽段質量，可以定位磷酸化位點。
在質譜分析中，蛋白質或肽段被電離成帶電粒子，然後透過質譜儀分離。質譜圖顯示了這些粒子的質荷比（m/z）與強度（訊號大小）的關係。質譜圖的解讀需要理解肽段的斷裂模式和磷酸化引起的質量變化。以下是解讀質譜圖以識別蛋白質磷酸化位點的基本步驟：
圖1
1.尋找磷酸化特徵訊號：
2.分析b離子和y離子序列：
3.使用質譜資料分析軟體：
多種軟體工具（如MaxQuant、Mascot等）可以幫助識別和驗證磷酸化位點，這些軟體可以自動匹配肽段序列，並標註潛在的修飾位點。
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