蛋白質修飾組學
蛋白質修飾組學(Proteomics of post-translational modifications, PTM proteomics)是研究蛋白質後轉錄修飾(Post-translational modifications, PTMs)的系統性分析方法。PTMs是細胞中的重要生物化學事件,它們在幾乎所有的生物過程中都起到關鍵作用,包括訊號傳導、細胞週期調控、基因表達和細胞死亡等。
蛋白質修飾組學的主要目標是:
1.確定蛋白質的所有修飾位點。
2.量化特定修飾的丰度變化。
3.解析不同修飾之間的相互作用和協同效應。
以下是蛋白質修飾組學中使用的關鍵技術和方法:
1.質譜分析:
這是蛋白質修飾組學中最常用和最有力的工具。它允許研究者確定蛋白質的修飾位點、型別以及修飾的丰度。
2.富集技術:
由於某些修飾(如磷酸化、乙醯化)可能存在於低丰度中,因此需要使用特定的方法(如抗體富集、親和純化)來富集含有這些修飾的蛋白片段或肽段。
3.標記量化:
例如同位素標記(如SILAC、iTRAQ、TMT)允許在不同的生物樣本或處理條件下定量比較蛋白修飾的丰度。
4.生物資訊學工具:
用於資料分析和解釋,幫助研究者確定潛在的生物學意義和與其他生物過程的關聯。
5.功能驗證:
使用分子生物學和細胞生物學技術驗證質譜資料,例如利用突變體或RNA干擾技術來探索特定修飾位點的功能。
蛋白質修飾組學為我們提供了寶貴的洞察,有助於深入瞭解細胞的訊號傳導網路、調控機制和生物學功能。隨著技術的進步,我們可以預期未來將有更多關於蛋白質修飾在健康和疾病中作用的深入瞭解。
圖1
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