蛋白磷酸化組學概述
蛋白磷酸化組學是一個研究蛋白磷酸化在全組水平上的科學領域。它不僅僅是單一蛋白質或少數蛋白質的磷酸化位點分析，而是旨在全面地鑑定和量化細胞、組織或生物體中所有蛋白質的磷酸化狀態。
一、背景
蛋白質磷酸化是最常見的蛋白質翻譯後修飾形式，對於調控細胞訊號傳導、生長、死亡和其他許多細胞過程至關重要。蛋白磷酸化組學的目標是對這種修飾有一個全面的檢視，提供更深入的理解關於細胞功能和疾病發展。
圖1. 酸化定量蛋白組學分析流程
二、主要技術
1、質譜分析：
液相色譜串聯質譜 (LC-MS/MS) 是最常用的工具，用於鑑定和量化磷酸化蛋白和磷酸化位點。
2、磷酸化肽段富集：
考慮到細胞內磷酸化蛋白的低丰度，通常需要採用特殊的技術來富集磷酸化多肽。常用的技術有：金屬氧化物親和色譜（MOAC）、鈦酸鹽親和色譜、IMAC（免疫親和色譜）等。
3、生物資訊學工具：
隨著磷酸化資料量的急劇增加，生物資訊學工具在資料分析、蛋白磷酸化位點預測、訊號通路分析中發揮了關鍵作用。工具如MaxQuant、Proteome Discoverer和Phosida等都在此領域得到廣泛應用。
三、應用
1、疾病研究：透過比較正常和病態細胞或組織的磷酸化模式，可以鑑定與特定疾病相關的磷酸化事件。
2、藥物開發：研究藥物如何改變蛋白磷酸化模式，幫助開發針對特定訊號傳導途徑的藥物。
3、細胞訊號傳導研究：深入瞭解細胞響應各種刺激或應激的機制。
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