蛋白翻譯後修飾組學中的平行反應監測（PRM）方法
蛋白翻譯後修飾（PTM）組學是研究蛋白翻譯後修飾的整體狀態和動態變化的學科。它涉及多種PTM型別，如磷酸化、乙醯化、SUMO化、泛素化、甲基化等。爲了高效且準確地檢測和定量蛋白質的PTM狀態，質譜技術，特別是靶向質譜方法如平行反應監測（PRM）已經被廣泛應用。
平行反應監測（PRM）是一種靶向質譜策略，適用於高選擇性、高靈敏度和高準確度的PTM定量。以下是關於蛋白翻譯後修飾組學中PRM的一些核心要點：
1.工作原理：
PRM策略使用高解析度和高質量精度的儀器在特定的母體/子離子對進行監測。這意味著在質譜實驗中只會檢測預先選擇的特定PTM位點或肽段。
2.樣品準備：
樣品通常經過酶解，之後根據特定的PTM進行富集，例如使用金屬親和色譜富集磷酸化肽段。
3.靶向性：
PRM是靶向策略，需要預先知道要監測的目標PTM肽段的資訊。
4.定量能力：
透過測量預先選擇的肽段的特定斷裂離子，PRM提供了高度準確的定量資訊，常與內標肽共同使用來提高定量準確性。
5.應用：
PRM適用於驗證非靶向質譜實驗中發現的PTM，或在生物樣品中進行精確定量。
6.與SRM/MRM比較：
PRM與選擇性反應監測（SRM）或多重反應監測（MRM）相似，但PRM利用高解析度儀器檢測所有可能的斷裂離子，從而提供了更多的資訊。
PRM為蛋白質PTM組學研究提供了一個強大的工具，特別是當需要高度的定量準確性和重複性時。它已經被廣泛應用於各種生物樣品和疾病模型中，以揭示PTM的功能和調控機制。
圖1
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