測量磷酸化蛋白時為什麼要同時測量總蛋白?

    當我們想要測量蛋白的磷酸化水平時,通常需要對照測量總蛋白的量,主要原因有以下幾點:


    1.歸一化和定量分析

    測量磷酸化蛋白的絕對水平通常並不足以提供有意義的資訊。相反,研究者通常更關心磷酸化蛋白與總蛋白的比例。透過對比磷酸化蛋白和對應的總蛋白,可以更準確地確定磷酸化的變化。


    2.樣品載入控制

    在進行如Western Blot這樣的實驗時,我們希望確保每個樣品孔載入的蛋白質總量是一致的。透過檢測一個不受實驗處理影響的“內參”或“載入控制”蛋白,我們可以確認樣品載入的一致性。如果我們只測量磷酸化蛋白而不測量總蛋白,我們無法確定觀察到的差異是由於實際的生物學變化還是簡單的樣品載入差異。


    3.確認磷酸化的特異性

    有時,我們可能會看到幾個磷酸化帶,但我們不確定哪個是特異性的。透過與總蛋白的檢測結果對比,我們可以確認哪個帶與我們感興趣的蛋白質對應,從而確定特異性的磷酸化帶。


    4.評估蛋白穩定性

    在某些情況下,某種處理或條件可能會導致蛋白質的降解。如果只測量磷酸化水平而不測量總蛋白,我們可能會錯誤地解釋為磷酸化水平的變化,而實際上是由於蛋白質的總量變化引起的。


    5.提高資料的可靠性

    當我們同時測量磷酸化蛋白和總蛋白,我們可以更有信心地解釋我們的資料,因為我們有一個穩定的參照物來對照。

    磷酸化定量蛋白組學分析流程

    圖1


    同時測量磷酸化蛋白和總蛋白可以提供更爲準確、可靠和具有生物學意義的資料,幫助研究者正確地解釋實驗結果。


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