蛋白質結構的層次與測定方法

    蛋白質結構是生物分子研究的核心領域,因為它們的結構與功能密切相關。蛋白質結構通常分為四個層次:一級結構、二級結構、三級結構和四級結構。

    蛋白質結構鑑定

    圖1

     

    1、一級結構(Primary Structure):

     

    (1)描述的是蛋白質的氨基酸序列。

    (2)這一連續的氨基酸鏈是透過肽鍵連線的。

    (3)一級結構決定了蛋白質的身份和許多其生物學性質。

    (4)測定方法:

    • 氨基酸測序:例如Edman降解法,可以連續地從蛋白質的一端切割並識別氨基酸。
    • 質譜分析:特別是串聯質譜,可以用於識別和測定氨基酸序列。

     

    2、二級結構(Secondary Structure):

     

    (1)描述的是蛋白質區域性的摺疊模式,例如α-螺旋和β-摺疊。

    (2)由氫鍵引起的區域性穩定結構,氫鍵是在氨基酸的主鏈之間形成的。

    (3)這些模式為蛋白質的三維結構提供了框架。

    (4)測定方法:

    • 圓二色光譜(CD):用於檢測蛋白質中α-螺旋、β-摺疊和無規則捲曲的內容。
    • 紅外光譜(IR):可以用於分析蛋白質的二級結構。

     

    3、三級結構(Tertiary Structure):

     

    (1)描述的是單個多肽鏈完整的三維結構。

    (2)三級結構是由於氨基酸的R基團之間的相互作用(如疏水作用、離子鍵、氫鍵和二硫鍵)引起的摺疊。

    (3)描述了蛋白質的整體空間排列。

    (4)測定方法:

    • X射線晶體學:分析純化並結晶化的蛋白質樣品,獲得蛋白質的高解析度三維結構。
    • 核磁共振(NMR)光譜:在液態條件下獲得蛋白質的三維結構資訊。
    • 冷凍電鏡(Cryo-EM):用於獲得大分子複合物的三維結構。

     

    4、四級結構(Quaternary Structure):

     

    (1)描述的是多個多肽鏈(亞單位)如何聚集形成完整的蛋白質複合體。

    (2)不是所有的蛋白質都有四級結構。只有由兩個或更多的多肽鏈組成的蛋白質纔有。例如:血紅蛋白由4個多肽鏈組成。

    (3)測定方法

    • X射線晶體學和冷凍電鏡:都可以用來分析大分子複合物的結構。
    • 凝膠過濾色譜和親和色譜:可以用於確定亞基之間的相互作用和組裝。

     

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