蛋白質N端和C端測序方法解析

    蛋白質的N端和C端測序是分析蛋白質序列中的氨基酸排列的方法,特別是序列的開始和結束位置。這種測序可以提供關於蛋白質的起源、結構和功能的重要資訊。

    蛋白質測序示意圖

    圖1


    一、N端測序(Edman 降解):


    Edman降解是一種經典的蛋白質N端測序方法。在這個過程中,蛋白質的N端氨基酸逐個被選擇性地移除,並進行識別。該過程可以連續進行,從而得到蛋白質的氨基酸序列的前幾個殘基。

    優勢:具有高度的準確性和靈敏性。

    缺點:該過程相對較慢,且難以測序長鏈的蛋白質。



    二、C端測序:


    與N端測序不同,C端測序的方法不如N端的成熟和普遍。蛋白質的C端通常可以透過酶切或化學切割來識別。利用特定的酶,如羧肽酶,可以從蛋白質的C端逐步地移除氨基酸。透過分析被移除的氨基酸,可以推匯出C端的序列。

    但是,這種方法通常受到蛋白質結構和酶切位置的限制,可能不適用於所有蛋白質。


    隨著質譜技術的進步,特別是串聯質譜,對蛋白質的全序列分析變得更加容易和準確。透過酶切蛋白質,然後使用質譜測序得到的片段,可以重構出蛋白質的整個氨基酸序列,從而得到N端和C端的資訊。


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