非靶蛋白組學測序
- 廣泛的覆蓋範圍:嘗試識別樣品中所有可檢測的蛋白質,而不僅限於特定的一組蛋白質。
- 發現導向:這種方法適用於探索性研究,其中研究目標不是驗證特定假設,而是發現新的模式、連線或者蛋白質功能。
- 生物標誌物的發現:在疾病診斷、藥物治療反應監測等領域,非靶蛋白組學可以用來發現新的生物標誌物。
- 疾病機制研究:透過比較健康和疾病狀態的組織或細胞的蛋白質組,可以幫助理解疾病的分子機制。
- 藥物作用機理:探索藥物處理對細胞蛋白質組的影響,揭示藥物的分子靶點和作用機理。
- 系統生物學研究:在系統生物學中,非靶蛋白組學有助於構建細胞和組織的蛋白質網路,理解複雜的生物學過程。
非靶向蛋白質組學旨在全面地分析生物樣品中的所有蛋白質,而不是關注特定的蛋白質,有助於研究蛋白質組的複雜性和發現新的蛋白質標誌物。蛋白質測序是確定蛋白質氨基酸序列的過程。它是生物學研究中的重要技術,用於瞭解蛋白質的結構和功能,以及研究與蛋白質相關的生物學過程。非靶向蛋白質測序則是一種全面性的蛋白質組學方法,旨在分析生物樣本中的所有蛋白質,而不是有選擇地測定特定的目標蛋白質。這種方法也稱為全蛋白質組學(shotgun proteomics)。
非靶蛋白組學測序的特點
非靶蛋白組學測序的一般步驟包括:
1、樣品製備:
從生物樣本中提取蛋白質,並對其進行適當的處理,例如蛋白質降解、還原和烷化。
2、液相色譜質譜分析:
使用液相色譜質譜技術(LC-MS/MS)將蛋白質樣品分離並進行質譜測定。這可以將樣品中的蛋白質分為許多片段,這些片段可以用於鑑定和定量。
圖1. 非靶向蛋白質組學
3、資料分析:
將質譜資料與資料庫中已知的蛋白質序列比對,以鑑定樣品中存在的蛋白質。此外,也可以使用未知蛋白質的分析方法來鑑定新的蛋白質。
4、定量分析:
透過質譜訊號的強度來定量每個鑑定的蛋白質,以瞭解它們在樣品中的相對丰度。
5、生物資訊學分析:
將鑑定和定量的蛋白質與生物學功能、通路和代謝網路等相關資訊進行關聯,以獲得更多關於樣品的生物學見解。
應用領域
百泰派克生物科技--生物製品表徵,多組學生物質譜檢測優質服務商
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