TMT(Tandem Mass Tags)技術是蛋白質組學研究中用於蛋白質定量分析的一種先進方法。TMT標記涉及使用一系列重量不同的化學標籤,這些標籤可以結合到肽段的氨基末端和側鏈上。透過這種方法,可以同時處理多個樣本,然後將它們混合在一起進行質譜分析。TMT技術允許多達16個不同的樣品同時進行定量分析,使其成為蛋白質組學研究中的一個強大工具。這種技術的關鍵優勢在於其能夠提供高通量、高靈敏度和高準確性的蛋白質表達水平比較。TMT圖譜的特點和分析過程包括:
1.樣品標記:
TMT標記涉及將不同的化學標籤連線到樣品中的肽段上。每個標籤具有相同的質量和結構,但在重同位素的組成上略有不同,從而在質譜分析中產生不同的訊號。
2.樣品混合和色譜分離:
標記後的樣品被混合在一起,然後透過液相色譜(LC)分離。
3.質譜分析:
分離的肽段透過質譜儀進行分析。在質譜儀中,TMT標記的肽段首先產生前體離子訊號,然後在碰撞誘導解離(CID)或高能碰撞解離(HCD)下分裂,產生獨特的標記離子。
4.定量分析:
TMT標記產生的報告離子在質譜圖中用於定量分析。透過比較不同標籤的報告離子的強度,可以定量比較各個樣品中的蛋白質表達水平。
5.數據處理和生物資訊學:
數據處理包括對齊、峰識別、定量分析以及與蛋白質資料庫的匹配。
生物資訊學分析用於鑑定蛋白質、進行功能註釋和生物學通路分析。
圖1.基於TMT的蛋白質組學服務工作流程
TMT技術的生物學意義
- 鑑定和定量後的資料用於進一步的生物資訊學分析,如功能註釋、通路分析和蛋白質相互作用網路的構建。
- 這些分析有助於理解蛋白質表達變化的生物學含義,如疾病機理、生物標誌物的發現或藥物作用的研究。
TMT技術因其高度的靈敏度和適用於大規模比較分析的能力,在蛋白質組學研究中越來越受到重視,特別是在疾病機理研究、藥物開發和生物標誌物篩選等領域。