SWATH定量蛋白組學
"SWATH" 是 "Sequential Window Acquisition of all Theoretical Mass Spectra" 的縮寫,它是一種質譜技術,常用於蛋白質組學定量分析。今天小編就帶大家一起了解一下 SWATH 定量蛋白組學的基本原理和特點:
圖1. SWATH定量蛋白組學服務技術平臺
1、基本原理:
在 SWATH 分析中,質譜儀連續地和自動地掃描一系列質量視窗,覆蓋所有潛在的前體離子。這樣,理論上所有可能的離子都會被檢測到。與定性的資料依賴掃描 (DDA) 相比,SWATH 為資料獨立掃描 (DIA) 提供了更加系統的、無偏的資料收集方式。
2、定量特點:
SWATH 的特點是它可以在複雜樣本中進行多成分的高通量、高重複性和高精度的定量分析。這使得它特別適合於那些需要大規模樣本佇列比較的研究,例如生物標誌物發現。
3、數據處理:
由於 SWATH 收集的資料是非常複雜的,它通常需要特定的軟體和演算法進行資料提取和定量。這些軟體會使用預先獲取的蛋白質/肽段的質譜相簿來輔助識別和定量。
4、應用領域:
SWATH 質譜技術在各種生物研究中都有應用,包括生物標誌物鑑定、通路分析、蛋白質-蛋白質相互作用研究等。
5、與其他技術的比較:
與傳統的資料依賴掃描 (DDA) 技術相比,SWATH 提供了更好的定量重複性和更廣的動態範圍。但由於其資料複雜性,資料分析可能會更加具有挑戰性。
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