SRM靶向蛋白質組學檢測技術
SRM(Selected Reaction Monitoring,選擇反應監測)是一種質譜技術,主要用於目標蛋白質或肽段的定量分析。SRM通常使用三重四極杆質譜儀(triple quadrupole mass spectrometer)進行操作,並且是一種高度敏感且特異性強的技術。
以下是SRM靶向蛋白質組學檢測的一些基本原理和步驟:
1、目標選擇:在實驗開始前,首先需要選擇希望測量的目標蛋白質或肽段。
2、肽段選擇:爲了檢測蛋白質,通常會選擇代表性的肽段(通常被稱為“肽圖”或“簽名肽”)來進行定量。
3、轉化為預定的離子:樣品在質譜儀中被電離,並且在第一個四極杆中選擇預設的前體離子(precursor ion)。
4、碎裂:選定的前體離子在碰撞細胞中與惰性氣體碰撞,產生碎片離子。
5、檢測特定碎片離子:在第二個四極杆中,特定的碎片離子被選擇並檢測。這一步提供了SRM的高度特異性。
6、定量:透過測量特定肽段的特定離子的強度,可以定量目標蛋白質在樣品中的丰度。
圖1. 平行反應監測(PRM)
由於SRM的高度特異性和靈敏度,它已經成為臨床研究和生物標誌物驗證中的一個重要工具。與傳統的非靶向質譜蛋白質組學技術相比,SRM提供了更高的定量準確性,尤其是在低丰度蛋白質的情況下。
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