質譜MRM與itraq/tmt定量對比檢測

1.引言

生物藥物研究領域中，蛋白質定量是一項重要的任務。準確地測量蛋白質的表達水平對於瞭解疾病機制、藥物研發以及生物標記物的發現具有關鍵意義。在蛋白質組學研究中，質譜技術是一種常用的方法。本文將重點介紹質譜MRM（多反應監測）與iTRAQ/TMT定量兩種常見的蛋白質組學定量方法，並對其進行對比分析。

2.質譜MRM定量

質譜MRM是一種基於質譜技術的定量方法，它透過選擇特定的肽段和轉換反應離子對（transition）來實現對目標蛋白質的定量。首先，透過質譜技術對樣品進行分析，獲得肽段的質譜譜圖。然後，選擇特定的肽段和其對應的轉換反應離子對進行監測。透過測量這些離子對的峰面積，可以推斷出目標蛋白質的含量。

質譜MRM定量方法具有高靈敏度、高選擇性和高通量的特點。它可以同時監測多個肽段，從而實現對多個蛋白質的定量。此外，質譜MRM定量方法還可以透過穩定同位素標記技術（如15N標記）來實現絕對定量，提高定量結果的準確性。

3.iTRAQ/TMT定量

iTRAQ（同位素標記化反應標記）和TMT（同位素標記化標記）是兩種常用的蛋白質組學定量方法。它們透過在樣品中引入特定的同位素標記化試劑，將不同樣品的蛋白質進行標記，然後將標記的樣品混合在一起進行質譜分析。

iTRAQ和TMT定量方法具有高通量、高復現性和高靈敏度的特點。它們可以同時定量多個樣品，從而實現高通量的蛋白質組學研究。此外，iTRAQ和TMT定量方法還可以透過選擇性地標記特定的氨基酸殘基（如精氨酸和賴氨酸）來實現定量的精確性。

4..質譜MRM與iTRAQ/TMT定量的對比

質譜MRM和iTRAQ/TMT定量方法在蛋白質組學研究中都具有重要的應用價值，但它們也存在一些差異。

首先，質譜MRM定量方法具有更高的靈敏度和選擇性。它可以選擇性地監測目標肽段，從而避免了複雜樣品中其他干擾物質的影響。相比之下，iTRAQ/TMT定量方法需要對整個樣品進行質譜分析，可能會受到複雜樣品基質的干擾。

其次，質譜MRM定量方法適用於定量少量目標蛋白質的情況。它可以選擇性地監測目標肽段，從而實現對少量目標蛋白質的定量。相比之下，iTRAQ/TMT定量方法適用於同時定量多個樣品的情況，但對於少量目標蛋白質的定量可能不夠準確。

最後，質譜MRM定量方法可以實現絕對定量，提高定量結果的準確性。透過穩定同位素標記技術，可以將質譜MRM定量結果與已知濃度的標準品進行比較，從而實現絕對定量。相比之下，iTRAQ/TMT定量方法只能實現相對定量，無法得到絕對定量結果。

5.結論

質譜MRM和iTRAQ/TMT定量方法是生物藥物研究領域中常用的蛋白質組學定量方法。質譜MRM定量方法具有高靈敏度、高選擇性和高通量的特點，適用於定量少量目標蛋白質的情況。iTRAQ/TMT定量方法具有高通量、高復現性和高靈敏度的特點，適用於同時定量多個樣品的情況。在選擇定量方法時，需要根據實驗的具體需求和樣品特點進行選擇。

iTRAQ和TMT標籤結構圖