高通量基因敲除後代謝組學分析
代謝組學透過定量測量細胞內的代謝物可以提供關於生物狀態的獨特視角，作為系統生物學的一個關鍵分支，其致力於分析和解釋生物體內所有代謝物的綜合集合。藉助質譜（MS）和核磁共振（NMR）等核心技術，我們可以精準地測量和比較不同條件下的代謝物變化，從而深入理解疾病機制和物質代謝路徑。隨著科技的進步，尤其是高通量基因敲除技術的發展，如CRISPR-Cas9系統的應用，我們現在能夠在更細緻的層面上探索基因如何影響細胞的代謝過程。
高通量基因敲除技術使得在多種細胞型別和生物模型中同時敲除數百甚至數千個基因成為可能，藉助該技術我們可以快速構建大量基因敲除細胞株，從而在系統層面上分析基因功能和基因網路。結合代謝組學質譜技術，研究人員能夠分析敲除特定的代謝相關基因後細胞或組織中代謝產物的組成及丰度等變化，研究特定基因對代謝通路的影響，在全基因組水平上理解基因如何調控細胞代謝。例如，敲除特定的代謝相關基因後，可以觀察到細胞內特定代謝物的變化，從而揭示這些基因在代謝途徑中的作用。
百泰派克生物科技（BTP）基於高解析度代謝組學分析平臺，結合高通量基因敲除技術，可以為您提供從基因敲除到代謝組分析的一站式解決方案。我們最佳化的CRISPR/Cas9系統可實現人/小鼠細胞系、原代細胞、免疫細胞及iPS細胞的單/多基因敲除、移碼突變和大序列敲除。獲得KO細胞後對其進行培養並提取KO細胞產生的代謝物，利用高分辨液質聯用平臺（LC-MS、GC-MS）以及核磁共振平臺進行代謝組分析，鑑定代謝物種類及水平的變化，揭示特定敲除基因對代謝網路的影響。BTP自建7大檢測平臺，擁有CNAS/ISO9001雙重質量體系認證實驗室，旨在為您提供最優質的科研服務，我們期待與您的合作，歡迎免費聯絡我們，瞭解更多服務詳情！
服務優勢
1）敲除效率保證：最佳化的CRISPR/Cas9系統，超過80%靶點敲除效率在70%；基因敲除後，我們採用Sanger測序和深度蛋白質組學技術對敲除效率進行雙驗證，雙重保障資料的真實性。
2）完善的代謝組學分析平臺：我們的代謝組學分析平臺配備完善的樣品前處理儀器（包含細胞破碎儀、組織破碎儀、組織研磨儀等）、超高效液相色譜高分辨質譜聯用（Orbitrap Exploris 240 & Orbitrap Exploris 480 With FAIMS Pro），可實現組學水平上代謝物的高效提取、定性鑑定和相對定量（3D & 4D）、絕對定量分析。
3）專案週期短：在進行基因敲除實驗前，我們會對不同細胞中基因必要性及表達量進行分析，確保實驗的可行性，降低實驗失敗風險；且無需針對客戶的靶點設計預實驗進行gRNA驗證，大大縮短了專案週期。
4）一站式服務：BTP擁有豐富的組學服務經驗以及專業的技術人員，可以根據您的需求定製最優的專案方案，您只需將您的實驗目的告訴我們並寄送樣品，BTP負責所有專案後續，包括樣品處理、實驗分析、資料分析和專案報告。
應用案例
溶質載體 OCTN1 (SLC22A4) 是一種獨立轉運蛋白，其生理上重要的底物仍未確定。爲了研究OCTN1 的生理作用。研究人員首先構建了溶質載體OCTN1基因敲除（octn1-/-）小鼠，然後透過代謝組分析以鑑定體內的底物。結果發現，octn1-/-小鼠的血液和幾種器官中缺乏一種天然的強效抗氧化劑——鳥嘌呤。這項研究揭示了OCTN1在維持體內和腸道鳥嘌呤暴露中的關鍵作用，可能對預防腸道組織損傷很重要，也為診斷炎症性腸病提供了一種可能的方法。
Kato Y,et al.,Pharm Res.
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