RNA-seq的實驗流程
RNA-Seq（RNA測序）是一種利用高通量測序技術來研究細胞中的RNA的存在和數量的技術。以下是RNA-Seq實驗的基本流程：
1.樣本準備:
首先收集你感興趣的細胞或組織樣本。
2.RNA提取:
選擇合適的方法（如使用柱技術或珠子技術）從樣本中提取總RNA。
3.RNA純化:
通常使用磁珠或柱來除去DNA和蛋白質等雜質。
4.RNA質量評估:
透過奈米孔測量儀、生物分析儀或瓊脂糖凝膠電泳等方法來檢查RNA的完整性和濃度。
5.RNA文庫構建:
將提取的RNA逆轉錄為cDNA，並打斷成適當長度的片段（通常使用物理切割或酶切割的方式），隨後透過PCR擴增進行富集。在cDNA片段的兩端連線測序接頭，以便在測序平臺上進行識別。
6.測序:
將處理後的文庫載入到測序儀上進行高通量測序。
7.數據處理:
測序產生的原始資料（即測序讀數）通常會透過生物資訊學的方法進行處理，包括質量控制、比對到參考基因組、讀數的定量和差異表達分析等。
這個過程可以揭示不同條件下基因如何被上調或下調，以及非編碼RNA、可變剪接事件等複雜的轉錄特徵。
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