只有氨基酸序列的話怎麼做GO與KEGG分析啊？
如果你只有蛋白質的氨基酸序列，進行GO（Gene Ontology）和KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）分析涉及將你的序列與已知的基因或蛋白質進行比對，然後使用這些資訊進行功能註釋和通路分析。詳細步驟如下：
一、序列比對和蛋白質鑑定：
1.使用BLAST（基本區域性序列比對工具）或其他序列比對工具將你的氨基酸序列與公共資料庫（如NCBI、UniProt等）中的已知蛋白質進行比對。這將幫助你確定序列的潛在身份。
2.提取比對結果中的最佳匹配項，特別是那些具有高相似性和序列覆蓋率的項，作為待分析蛋白質的候選項。
二、提取基因識別符號：
一旦你有了潛在的蛋白質匹配，你需要獲取這些蛋白質相對應的基因名稱或識別符號。這些通常可以在相應的資料庫條目中找到。
三、GO和KEGG註釋：
1.使用各種生物資訊學工具和資料庫（如DAVID, UniProt, STRING, Gene Ontology website等）輸入你的基因或蛋白質識別符號進行GO和KEGG分析。
2.對於GO分析，你將獲得與你的蛋白質相關的生物過程、細胞組分和分子功能的資訊。
3.對於KEGG分析，你將瞭解你的蛋白質可能涉及的代謝或訊號傳導通路。
四、富集分析：
1.如果你有一個蛋白質列表（例如，來自一個實驗條件），你可能想知道哪些生物學功能或通路在你的列表中富集。這需要使用富集分析工具（如DAVID, g:Profiler, ClusterProfiler R包等）。
2.這些工具將評估特定的GO術語或KEGG通路是否在你的蛋白質集合中過度表示，相對於整個基因組或背景蛋白質集合。
五、結果解釋和視覺化：
1.解釋你的分析結果，確定哪些功能或通路可能是生物學上相關的。
2.使用各種工具和軟體（如Cytoscape, g:Profiler等）將你的結果視覺化。
百泰派克生物科技--生物製品表徵，多組學生物質譜檢測優質服務商
相關服務：
How to order?
