使用DEseq2進行轉錄組差異表達分析,實驗組和對照組樣本數量必須相同嗎?
使用DEseq2進行轉錄組差異表達分析時,實驗組和對照組樣本數量並不一定要相同。DEseq2基於負二項分佈模型來估計基因表達的離散性,並使用負二項分佈模型來進行差異表達分析。
DEseq2對於實驗組和對照組樣本數量的要求並不嚴格。實際上,DEseq2可以處理不同條件下的不同樣本數量。在DEseq2中,樣本數量的不同會影響到差異表達分析的統計功效和結果的可靠性。當實驗組和對照組樣本數量不同時,DEseq2會根據樣本數量的不同來調整差異表達分析的統計模型。具體來說,DEseq2會使用負二項分佈模型來估計每個基因的離散性,並根據樣本數量的不同來調整模型的引數。這樣可以更準確地估計基因表達的離散性,並提高差異表達分析的統計功效。
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