KEGG圖如何分析？

KEGG圖是基因組、代謝組和訊號傳導網路的視覺化表示。它由節點和邊組成，節點代表基因、化合物或反應，邊代表它們之間的關係。




1.解讀KEGG圖的節點：

• 節點可以是基因、代謝物或反應。瞭解節點的含義和功能是分析KEGG圖的關鍵。
• 對於基因節點，可以查詢其註釋資訊，瞭解其命名、功能和調控機制。
• 對於代謝物節點，可以查詢其化學結構和代謝途徑，瞭解其在生物系統中的作用。
• 對於反應節點，可以瞭解其催化物和生成物，以及參與該反應的基因和代謝物。




2.分析KEGG圖的邊：

• 邊表示節點之間的關係，可以是基因調控、代謝物轉化或訊號傳導等。
• 分析邊的型別和方向可以揭示基因、代謝物和訊號通路之間的相互作用和調控關係。
• 可以透過計算節點之間的距離、度中心性等網路引數來評估節點的重要性和網路的穩定性。




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