怎麼簡單的做Go註釋分析?
- DAVID (Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery): 是一個非常流行的線上生物資訊學工具,提供了一系列功能,包括GO富集分析。
- g:Profiler: 是另一個流行的線上工具,允許使用者進行GO富集分析以及其他多種型別的功能富集分析。
- PANTHER:一個提供GO和通路分析功能的線上工具。
- 開啟你選擇的線上工具。
- 將你的基因列表貼上到相應的輸入框中。
- 根據你的研究物種,選擇適當的背景基因集。這通常是整個基因組,但也可以是一個特定的基因子集。
- 執行分析。
- 工具將返回與你的基因列表顯著富集的GO術語。這些術語分為三大類:生物過程(BP),分子功能(MF)和細胞組分(CC)。
- 對於每個GO術語,你通常會得到一個p值,表示該術語在你的基因列表中的富集程度是多麼顯著。一般情況下,經過多重檢驗校正後的p值較小(例如,<0.05)表示該GO術語在你的基因列表中顯著富集。
要簡單地進行GO(Gene Ontology)註釋分析,你可以遵循以下步驟:
1.準備你的基因列表:
首先,你需要一個你感興趣的基因列表,例如,來自轉錄組測序的差異表達基因列表。
2.選擇一個線上工具:
有多個線上工具可以簡單地進行GO註釋和富集分析。以下是一些常用的工具:
3.進行GO富集分析:
4.解釋結果:
5.視覺化:大多數工具還提供了結果的視覺化選項,如條形圖、散點圖或樹狀圖,幫助你更直觀地理解結果。
百泰派克生物科技--生物製品表徵,多組學生物質譜檢測優質服務商
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