PLS-DA 計算R2和Q2,除了ropls包,還有別的包嗎?

    在R語言中,ropls包是一個常用的用於PLS-DA建模和分析的包,它提供了計算R2和Q2的函式。可以使用ropls包中的perf函式來計算R2和Q2。


    除了ropls包,還有其他包也提供了計算R2和Q2的功能。其中一個常用的包是caret包。caret包是一個用於機器學習和資料探勘的綜合性包,它提供了許多模型評估和效能度量的函式。


    在caret包中,可以使用train函式來訓練PLS-DA模型,並使用trainControl函式來設定交叉驗證的引數。透過設定summaryFunction引數為"twoClassSummary",可以計算出PLS-DA模型的R2和Q2。


    另外一個包是pls包,它是一個專門用於偏最小二乘迴歸和偏最小二乘判別分析的包。在pls包中,可以使用plsr函式來訓練PLS-DA模型,並使用summary函式來計算R2和Q2。


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