10X單細胞測序是不是隻測3'UTR的那部分？

10X單細胞測序技術基於GEM（Gel Bead in EMulsion）技術，將單個細胞與一系列的微滴中的瓊脂糖珠（gel bead）一起封裝在油水混合物中。每個瓊脂糖珠上都有一種特定的條形碼，用於標記來自同一細胞的RNA分子。細胞在微滴中被裂解，RNA與瓊脂糖珠上的條形碼進行反應，形成RNA-條形碼複合物。複合物經過逆轉錄和擴增，生成cDNA，然後進行測序。

10X單細胞測序技術主要關注的是mRNA的轉錄本，而不是特定的區域，如3'UTR。在cDNA合成過程中，使用的是一種稱為oligo-dT的引物，它可以選擇性地逆轉錄mRNA的poly(A)尾部。因此，10X單細胞測序可以捕獲到mRNA的全長，包括5'端、CDS（Coding Sequence）和3'端。

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