當ph大於蛋白質的等電點的時候,蛋白質不應該帶負電嗎?這個時候用質譜負模式為什麼檢測不到?
是的,當pH大於蛋白質的等電點(pI)時,蛋白質會帶負電。這是因為在這種條件下,蛋白質中帶正電的氨基酸殘基(如賴氨酸、精氨酸和組氨酸)的質子會丟失,而帶負電的氨基酸殘基(如天冬氨酸和穀氨酸)的負電荷保持不變。結果是,整個蛋白質帶有負電荷。
然而,在質譜分析中,負模式很少用於蛋白質檢測,原因如下:
1.電噴霧離子化(ESI):
在蛋白質質譜分析中,最常用的離子化方法是電噴霧離子化(ESI)。ESI在正模式下的效果通常比負模式下更好,因為正模式下更容易產生多質子化的蛋白質離子。這些多質子化的離子具有較低的質量/電荷比,便於質量分析器進行檢測。
2.碎片化效率:
對於負模式,碎片化效率通常較低。這意味著在負模式下,產生足夠的資訊以識別蛋白質序列的肽段碎片較為困難。而在正模式下,碎片化效率更高,產生更多的有用資訊。
3.離子源和質量分析器的相容性:
許多質譜儀器的離子源和質量分析器在正模式下的效能更好。負模式下可能需要改變儀器引數,例如離子源電壓和氣體流速,這可能導致靈敏度降低或訊號失真。
因此,儘管蛋白質在高於等電點的pH條件下帶有負電荷,但在質譜分析中,通常使用正模式來檢測蛋白質,因為正模式具有更高的靈敏度和碎片化效率。
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