RNA pulldown 切下的膠送質譜如何切,如何存放?
RNA pulldown 是一種常用的生物實驗方法,透過這種方法,研究人員可以鑑定與特定 RNA 分子相互作用的蛋白質。對RNA pulldown 後的凝膠進行正確切割和儲存對進一步的質譜分析非常重要。需注意:
1.在切割之前應先使用紫外光源或染料對凝膠進行染色,以便於在凝膠上觀察到目標蛋白質,常用的染色方法有考馬斯亮藍和銀染。
2.在低背景和清潔的條件下切割凝膠。在操作過程中,請務必避免將蛋白質樣品汙染。
3.在凝膠中定位目標蛋白質,並使用鋒利的刮刀或剪刀沿著目標蛋白質條帶的上下邊緣進行切割。在切割過程中,儘量減少不必要的凝膠損失。
4.將切下的凝膠條帶放入適當的離心管中。推薦使用較小容量的離心管,如1.5ml或2ml的離心管。避免將不同凝膠條帶混合在同一個離心管中,這樣可以避免樣品混淆。
5.爲了防止樣品在質譜分析前降解,請將離心管內的凝膠條帶冷凍儲存。建議將離心管放入-20℃或-80℃的冰箱中儲存。請確保離心管蓋嚴密封閉,以免樣品受到空氣和溼度的影響。
6.在進行質譜分析之前,將凝膠條帶從冰箱中取出並解凍。接下來,對凝膠條帶進行必要的處理,如洗滌、脫色、還原、煮沸等,以便質譜分析中蛋白質的鑑定和檢測。
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