如何提取磷酸化蛋白?
磷酸化蛋白的提取需要特定的步驟和試劑,以確保在提取過程中磷酸化位點不會被去磷酸化,並且可以有效地富集和檢測這些蛋白。可以下參考以下步驟:
1.製備磷酸化蛋白提取緩衝液:
磷酸化蛋白提取緩衝液通常包括適量的鹽、非離子表面活性劑、磷酸酶抑制劑和蛋白酶抑制劑。磷酸酶抑制劑(如鈉酸鈉、鈉釩酸鹽等)和蛋白酶抑制劑(如PMSF、甲醯基肼等)的新增是爲了保護磷酸化位點和防止蛋白降解。
2.細胞裂解:
使用含有磷酸酶抑制劑的裂解緩衝液裂解細胞,以獲取細胞內的蛋白質。裂解過程可以透過超聲、液氮研磨或其他適當的方法完成。裂解過程中,需要保持低溫,避免磷酸化位點的去磷酸化和蛋白降解。
3.蛋白質提取:
將裂解的細胞透過離心等方式去除細胞殘骸和未裂解的細胞,從而得到含有蛋白質的上清液。
4.蛋白質濃度測定:
使用BCA、Bradford等方法測定蛋白質的濃度,以便後續實驗使用。
5.(可選)磷酸化蛋白富集:
如果需要富集磷酸化蛋白,可以使用親和純化方法,如IMAC(金屬螯合親和層析)或TiO2(二氧化鈦)富集。透過與特定金屬離子或材料的結合,磷酸化肽段或蛋白可以從複雜的蛋白質混合物中富集。
6.儲存:
將提取的磷酸化蛋白儲存在-80℃或其他適當的低溫條件下,以保護磷酸化位點和避免蛋白降解。磷酸化蛋白在低溫儲存下可以保持穩定性,以供後續實驗使用。
提取的磷酸化蛋白可以透過各種實驗方法對其進行分析和驗證。例如,使用SDS-PAGE進行蛋白質電泳,檢查目標蛋白的純度和大小;使用Western blot技術,結合磷酸化位點特異性抗體,檢測磷酸化蛋白的表達和磷酸化水平;採用質譜技術分析磷酸化位點和蛋白質相互作用。
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