iTRAQ/TMT實驗的中"組分"或者"SCX分級"代表什麼?

    iTRAQ/TMT實驗中的“組分”或“SCX分級”是指在肽段混合後,透過強陽離子交換色譜(Strong Cation Exchange Chromatography, SCX)將混合的肽段進行分級分離的過程。這一步是爲了降低複雜度,以便後續液相色譜-質譜(LC-MS/MS)分析。


    SCX是一種基於肽段帶正電荷的液相色譜分離技術。在SCX色譜柱中,固定相上的化學基團帶負電荷,可以與肽段上的正電荷相互作用。在實驗過程中,透過改變流動相中的鹽濃度和pH值,可以調整肽段與固定相之間的相互作用,從而實現不同肽段的分離。通常,肽段在SCX柱上的保留時間與其正電荷數成正相關,正電荷數較小的肽段先被洗脫,而正電荷數較大的肽段保留時間較長。


    在iTRAQ/TMT實驗中,SCX分級的主要目的是進一步降低肽段複雜度,提高質譜檢測的靈敏度和準確度。SCX分級後得到的組分可以分別進行反相液相色譜-質譜(RP-LC-MS/MS)分析,從而提高蛋白質鑑定和定量的覆蓋範圍。


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