label free蛋白組學質譜的原理是什麼？

Label-free定量蛋白組學是一種基於質譜的蛋白質定量方法，不需要對蛋白質或肽段進行化學標記。與同位素標記方法（如iTRAQ、TMT和SILAC）相比，label-free方法具有操作簡便、成本較低、適用樣品範圍廣等優點。




Label-free蛋白組學質譜主要依據兩種定量策略：基於肽段強度的定量和基於肽段譜計數的定量。




1.基於肽段強度的定量（Intensity-based quantification）：

在這種策略中，肽段的丰度透過其在質譜中的訊號強度（即離子強度）來估算。實驗中，透過對不同樣品進行液相色譜-串聯質譜（LC-MS/MS）分析，比較相同肽段在不同樣品中的訊號強度，從而實現蛋白質定量。為提高定量準確性，通常需要對肽段強度進行歸一化處理，如總離子強度歸一化或內標歸一化等。




2.基於肽段譜計數的定量（Spectral counting-based quantification）：

在這種策略中，肽段的丰度透過其在質譜中的譜計數（即匹配肽段的譜圖數量）來估算。實驗中，透過統計不同樣品中相同肽段的譜計數，實現蛋白質定量。譜計數定量方法需要對資料進行歸一化處理，如NSAF（Normalized Spectral Abundance Factor）等。




北京百泰派克生物科技——生物藥物表徵，多組學生物質譜檢測優質服務商




相關服務:

基於Label Free的定量蛋白組分析

定量蛋白組分析