蛋白分析FAQ彙總

相比二維電泳，基於液相色譜-質譜（LC-MS）的蛋白組學技術（如iTRAQ）在多個方面具有優勢。以下是一些主要優點：更高的通量：LC-MS技術比二維電泳更高效，可以在較短的時間內分析更多的樣品。LC-MS實驗可以在幾小時內完成，而二維電泳可能需要一天或更長時間。更廣泛的動態範圍：

KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）是一個包含基因、蛋白質、代謝途徑等多種生物資訊的資料庫。在進行富集分析（例如，基因富集分析或代謝物富集分析）時，我們經常使用KEGG路徑來幫助解釋實驗結果。使用KEGG進行富集分

Western blot（WB）是一種常用的生物技術方法，用於研究蛋白質的表達和修飾。對於高分子量蛋白，如apolipoprotein B (ApoB, 515 kDa)，轉膜可能會遇到一些困難。以下這些建議可以幫助您成功地將ApoB從凝膠轉移到膜上： 1.轉膜緩衝液：

質譜聯用技術將質譜（MS）與其他分析技術（如色譜）結合，可以用於檢測和分析多種型別的化學物質。這些物質包括有機化合物、生物大分子、藥物、環境汙染物等。常見的質譜聯用技術有氣相色譜-質譜（GC-MS）、液相色譜-質譜（LC-MS）、毛細管電泳-質譜（CE-MS）和離子色譜-質譜

在大腸桿菌中表達蛋白並透過鎳柱純化後，蛋白質質譜中出現聚合物訊號的原因可能有以下幾點： 1.蛋白質本身易於聚合：有些蛋白質在表達、純化或儲存過程中可能會自發地形成聚合物，如二聚體、三聚體等。這些聚合物可能是由於蛋白質結構的特性、氨基酸序列或疏水區域的相互作用導致的。

腸道組織的水解氨基酸測定通常是透過對組織樣本進行酸水解，然後利用高效液相色譜（HPLC）或氨基酸分析儀等方法進行氨基酸含量的定量分析。在進行實驗前，需要對組織樣品進行處理。凍幹樣品是一種常見的處理方法，因為它有助於去除水分、降低生物活性，使樣品易於儲存和運輸。然而，使用鮮樣進

多肽（Polypeptide）是由數個到數百個氨基酸透過肽鍵連線而成的生物大分子。多肽是蛋白質的基本組成單位。關於多肽與蛋白質之間的區別，學術界沒有一個嚴格的長度定義，但通常是根據氨基酸的數量來進行區分。一般來說，氨基酸長度在50個或更少的生物大分子被稱為多肽。這種定

磷酸化蛋白質組學資料分析包括從原始LC-MS/MS資料中提取資訊、蛋白質鑑定、磷酸化位點定位、定量分析以及功能和通路分析等步驟。以下是進行磷酸化蛋白質組學資料分析的一般流程： 1、資料預處理：對原始LC-MS/MS資料進行預處理，包括峰檢測、峰匹配、峰對齊等，將原始資料

高效液相色譜（HPLC）的積峰面積應該始終是正數，因為它代表了化合物在色譜圖上的峰面積。如果積峰面積為負數，則可能是由以下原因引起的： 1.峰寬太寬：如果峰寬過寬，積峰面積可能會出現負值。這是因為HPLC儀器在峰的左側和右側各有一個基線，如果峰的寬度超過了這些基線，則積

對於結構類似、分子量接近的蛋白質，使用一些傳統的蛋白質分離方法可能效果有限。然而，仍然有一些方法可以嘗試用來有效地分離這些蛋白質： 1.離子交換層析：利用蛋白質表面上的電荷差異，在一個帶電的柱子上進行分離。選擇合適的離子交換介質和緩衝液條件，可以提高分離效果。 2

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