蛋白分析FAQ彙總

• • iTRAQ標記定量和2D-GE相比有哪些優勢？

  1、iTRAQ可鑑定低丰度蛋白；2、克服修飾蛋白乾擾；3、通量高，可定性定量鑑定成百上千種蛋白，且一次實驗可同時標記4-8個樣本。相關服務:基於標籤的蛋白質定量技術-iTRAQ，TMT， SILAC

• • Label free、iTRAQ、TMT、SILAC和SWATH蛋白定量技術該如何選擇？

  Label free、iTRAQ、TMT、SILAC和SWATH是目前主流的基於質譜的蛋白質定量技術，這五種技術的原理和優劣各有不同，實際應用時可根據自己的需求進行選擇。Label free非標定量價格相對便宜，但是不能避免系統誤差，定量的準確性稍差；iTRAQ和TMT都是體外同位素標記定量

• • 蛋白質組學能做什麼，可用於那些研究？

  蛋白質組學可以對樣品中的蛋白質進行大規模的定性定量鑑定、翻譯後修飾狀態鑑定、差異蛋白分析、相互作用網路分析以及蛋白質功能分析等，可用於篩選鑑定潛在生物標誌物、重要訊號通路，實現疾病的分子分型分析等。相關服務:蛋白質組學

• • 用於研究蛋白質組學的質譜技術和蛋白晶片哪個更好出結果？

  二者都可以用於蛋白質定性定量鑑定分析、相互作用分析等，蛋白晶片旨在對特定的感興趣蛋白進行研究或驗證，可以理解為具有一定的靶向性；質譜技術既可以用於從大量蛋白中篩選感興趣蛋白也可以只對感興趣蛋白進行研究，可用於靶向和非靶向蛋白質組學研究。相關服務:蛋白質質譜鑑定

• • 檢索蛋白質組學質譜資料時怎麼選擇資料庫？

  首選該物種的全蛋白序列庫，如果該物種未進行全基因組測序或沒有預測的全蛋白序列庫，也可以選擇該物種的轉錄組測序資料；若這兩者都沒有，可以選擇與該物種親緣關係最近的或者所在屬/科的蛋白質資料庫。相關服務:蛋白質質譜鑑定

• • 為什麼質譜鑑定不到IP目標蛋白？

  1、可能IP實驗本身存在假陽性；2、目標蛋白的丰度太低未達到質譜檢測的標準；3、樣品中存在高丰度汙染蛋白，其質譜訊號覆蓋了目標蛋白的訊號。相關服務:蛋白膠點、膠條、IP樣品蛋白質鑑定

• • 蛋白質組學全譜分析和定量分析分別能鑑定多少蛋白？

  全譜分析和定量分析都能鑑定到大量的蛋白質，他們能鑑定到的具體蛋白數量與樣品的複雜程度也有一定關係，通常情況下，全譜分析可以鑑定3000個蛋白左右，定量分析可鑑定的蛋白在6000個左右。相關服務:蛋白質質譜鑑定

• • 如何驗證組學資料？驗證結果與組學結果不一致怎麼辦？

  可以透過WB、ELISA、IHC、qPCR等實驗對組學結果進行驗證，如果驗證結果與組學結果不一致可以再試試其他的驗證方法，當多種驗證結果都與組學結果存在出入時，可以考慮組學結果是否存在假陽性，是否需要重新篩選差異靶點。相關服務:蛋白質組學

• • 做膠點/膠條質譜鑑定需要多少蛋白？

  一般考染後肉眼清晰可見的膠條/膠點都可以用於質譜鑑定。相關服務:蛋白膠點、膠條、IP樣品蛋白質鑑定

• • 2D-GE採用銀染染色的方法會對後續的質譜鑑定產生影響嗎？

  銀染的樣品有可能與後續的質譜分析不相容，我們推薦您使用下面的產品或者實驗步驟進行銀染實驗：ProteoSilver Plus, Sigma (Product # PROTSIL1 or PROTSIL2)、Dodeca Silver Stain, BioRad (Product # 161-