蛋白分析FAQ彙總

• • 什麼是CID和CAD？

  CID-碰撞誘導解離，是一級質譜解離方式，通常在真空介面處調節電壓發生CID現象。CAD-碰撞活化解離是二級質譜解離方法，選定的母離子被碰撞活化產生子離子的過程。相關服務:蛋白質質譜鑑定

• • 串聯質譜MS/MS是如何定量的？

  串聯質譜是以母離子二級質譜產生的碎片峰（子離子）進行定量的。相關服務:蛋白質質譜鑑定

• • 蛋白質鑑定服務——質譜法鑑定蛋白質的工作原理是什麼？

  用胰蛋白酶將蛋白質消化成肽段，然後將每個肽段電離並在質譜儀中單獨分析。該過程透過斷開氨基酸將每個肽段進行片段化，並使用 Mascot 搜尋演算法將得到的片段光譜與資料庫進行比較，以尋找相同的氨基酸序列。這個過程可以鑑定已知的蛋白質，或密切相關的蛋白質。 注意：對於無法透過自動資料庫分析鑑定的

• • PCT提取蛋白對溫度有什麼特殊要求嗎？

  PCT提取蛋白對溫度沒有特殊要求，輔助樣本裂解和酶解基本是在室溫或者30℃的溫度下進行的。相關服務:PCT-DIA蛋白質組學

• • PCT-DIA技術只能分析石蠟切片組織嗎？

  不是的，細胞樣本、石蠟組織穿刺樣本、新鮮組織/臨床活體穿刺組織、石蠟組織切片/甲醛固定組織切片等樣品都可以做PCT-DIA分析。相關服務:PCT-DIA蛋白質組學

• • iTRAQ和Label-free所用的搜庫軟體是一樣的嗎？

  二者使用的資料庫軟體不同，iTRAQ一般使用Mascot（2.3.0）進行檢索；Label-free則是使用Maxquant（1.4.1.2）進行檢索。相關服務:定量蛋白組分析

• • 常用的PTM參考資料庫有哪些？

  翻譯後修飾蛋白質組資料庫主要有SysPTM（http://lifecenter.sgst.cn/SysPTM/）、PhosSNP（http://phossnp.biocuckoo.org）、hUbiquitome（http://bioinfo.bjmu.edu.cn/hubi/）、CPLA（

• • 公司採用什麼蛋白酶進行酶解？

  百泰派克採用胰蛋白酶（Trypsin）、糜蛋白酶（Chymotrypsin）、天冬氨酸蛋白酶（Asp-N）、穀氨酸蛋白酶（Glu-C）和賴氨酸蛋白酶（Lys-C、Lys-N）等進行多重酶解。相關服務:蛋白質質譜鑑定

• • 什麼是分子離子？

  分子離子是待分析的物質分子被質譜儀的電子束轟擊失去一個電子形成，常用用 M+表示。相關服務:蛋白質質譜鑑定

• • 什麼是分子離子峰？

  質譜圖中，與分子離子相對應的峰為分子離子峰，分子離子峰的質荷比是測量化合物相對分子質量的重要依據。相關服務:蛋白質質譜鑑定